🧬 Набор 3: Создание ДНК-диагностикума для обнаружения SNP

Уровень: Продвинутый (студенты 3–4 курсов, магистранты)

Цель: Обучить студентов разрабатывать собственные диагностические системы для выявления однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) — мельчайших, но функционально значимых изменений в ДНК, связанных с наследственными заболеваниями, предрасположенностью к болезням или фармакогенетикой.

Основные этапы и методы:

1. Выбор целевого SNP

   1. Изучение баз данных (например, dbSNP), выбор клинически значимого полиморфизма (например, в гене MTHFR или CYP2C9).
2. Химический синтез ДНК-фрагментов

   1. Заказ или самостоятельное моделирование двух аллельных вариантов (например, дикого типа и мутантного).
   2. Введение SNP в синтезированный олигонуклеотид
3. Клонирование синтетических фрагментов

   1. Встраивание в экспрессионный или диагностический вектор.
   2. Верификация последовательности (секвенирование по Сэнгеру).
4. Разработка аллель-специфичной qPCR-системы

   1. Дизайн праймеров и зондов, различающих один нуклеотид.
   2. Оптимизация условий реакции для максимальной специфичности.
   3. Тестирование системы на «модельных» образцах (клонированные плазмиды).

Приобретаемые навыки:

• Работа с генетическими базами данных
• Дизайн аллель-специфичных ассеев
• Молекулярное клонирование высокой точности
• Валидация диагностических систем
• Понимание клинической значимости генетических вариантов

Научная и образовательная ценность:

Этот набор имитирует реальный процесс разработки молекулярного теста — от идеи до прототипа. Он готовит студентов к работе в диагностических лабораториях, фармацевтической индустрии или научных проектах по персонализированной медицине.